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在世界顶尖侦探学校·青蓝被誉为天才的鸭乃桥论，因患上某个致命“缺陷”，被剥夺了成为侦探的资格。在度过一段怀才不遇的岁月后，与警视厅搜查一课的一色都都丸——外号“都都”的相遇，极大改变了他的命运。论负责解谜，都都负责侦查，他们接连侦破疑难案件，逐渐成为了名搭档。青蓝内部也有论的理解者在两眼发光地关注着他的动向。其中一人就是校长艾梅利希。她告诉论，导致他被开除的“染血实习案”是一个圈套。其幕后主使，是制造了众多悬案的“史上最凶恶的犯罪一族”——M家，家主名叫麦罗·莫里亚蒂。为了给予论更大的绝望，麦罗将妹妹·温特派往了日本。论与麦罗之间究竟有何恩怨？。将江户川乱步作品中的角色怪人二十面相改编成国际骇客集团，以遭受网路犯罪威胁的现代日本为舞台。。